典型文献
菝葜叶绿体基因组的组装分析与分子标记研究
文献摘要：
目的 采用高通量测序数据和新组装手段对药用植物菝葜的叶绿体基因组进行精细组装,并以此为基础厘清其分类地位,开发分子鉴定标记.方法 利用两种测序手段重新测定并精细组装菝葜叶绿体基因组;重建菝葜近缘物种在时间尺度下的系统发育关系;分析菝葜叶绿体基因组一级结构并检测编码区选择压力;筛选并验证具备种群特异性的SSR引物.结果 混合组装结果 显示菝葜叶绿体基因组全长157959 bp,内含编码基因86个.菝葜族与油点草族和百合族互为姐妹群;其内部约26.5Mya开始出现分化.在accD、rbcL及rpl20基因中存正选择信号.247个SSR位点中的3个具备作为菝葜分子鉴定标记的潜力.结论 利用短读长和长读长共同组装菝葜叶绿体基因组的结果 更佳.已探明的3个SSR位点能为筛选分子标记提供数据支撑.
文献关键词：
菝葜;叶绿体基因;高精度组装;分子标记;系统发育
中图分类号：
作者姓名：
钟浩天;蒋莉萍;江宇慧;胡志刚;余坤;刘义飞;森林
作者机构：
湖北中医药大学药学院 武汉 430065;湖北中医药大学教育部重点实验室 武汉 430065
文献出处：
引用格式：
[1]钟浩天;蒋莉萍;江宇慧;胡志刚;余坤;刘义飞;森林-.菝葜叶绿体基因组的组装分析与分子标记研究)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(04):1411-1421
A类：
5Mya,高精度组装,精度组装
B类：
菝葜,叶绿体基因组,分子标记,序数,对药,药用植物,分类地位,分子鉴定,近缘,时间尺度,系统发育关系,编码区,选择压力,SSR,引物,基因组全长,bp,编码基因,百合,合族,姐妹,accD,rbcL,rpl20,正选择,选择信号,点中
AB值：
0.275153
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