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波纹龙虾对亚硝酸盐胁迫响应的转录组学分析
文献摘要:
为了探究波纹龙虾Panulirus homarus对亚硝酸盐的胁迫响应机理,采用转录组学测序分析方法,进行了正常养殖条件下波纹龙虾(体质量为39.00 g±5.31 g)肝胰腺和质量浓度为80 mg/L亚硝酸盐胁迫7 d的肝胰腺转录组比较研究.结果表明:转录组共筛选得到264个差异表达基因,其中,86个基因上调表达,178个基因下调表达;GO功能注释显示,被注释的差异表达基因主要与结合、催化和代谢等功能有关;KEGG通路富集分析显示,差异表达基因在黏着斑、白细胞跨内皮层迁移、胰岛素抵抗、紧密连接、淀粉与蔗糖代谢等通路中显著富集;随机挑选9个差异表达基因进行qRT-PCR验证,发现荧光定量结果与测序结果基本一致.研究表明,在亚硝酸盐胁迫下,通过GO和KEGG分析发现差异表达基因主要富集在能量代谢、生长和免疫等通路中,挖掘出的数据可为后续研究提供科学参考.
文献关键词:
波纹龙虾;亚硝酸盐胁迫;转录组;差异表达基因
中图分类号:
作者姓名:
梁妃爽;梁华芳;卓宏标;孙榕泽;王潘妹;温崇庆
作者机构:
广东海洋大学 水产学院, 广东 湛江524088
文献出处:
引用格式:
[1]梁妃爽;梁华芳;卓宏标;孙榕泽;王潘妹;温崇庆-.波纹龙虾对亚硝酸盐胁迫响应的转录组学分析)[J].大连海洋大学学报,2022(05):809-816
A类:
B类:
波纹龙虾,亚硝酸盐胁迫,胁迫响应,转录组学分析,Panulirus,homarus,响应机理,转录组学测序,测序分析,养殖条件,肝胰腺,选得,差异表达基因,功能注释,通路富集分析,黏着斑,内皮层,层迁移,胰岛素抵抗,紧密连接,蔗糖代谢,qRT,能量代谢,挖掘出
AB值:
0.228523
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