典型文献
马氏珠母贝Kelch-like基因的序列及其SNP位点分析
文献摘要：
为了探究马氏珠母贝Pinctada fucata martensii Kelch样基因(Kelch-like)的功能,对Kelch-like基因序列及其SNP位点进行了分析.结果表明:马氏珠母贝Kelch-like序列全长为2127 bp,其中,5′UTR为58 bp,3′UTR为44 bp,其开放式阅读框长度为2025 bp,可编码674个氨基酸;预测其Kelch-like氨基酸序列含有1个BTB结构域、1个BACK结构域和2个Kelch结构域;马氏珠母贝Kelch-like与美洲牡蛎Kelch-like氨基酸序列的一致性最高(35％),其次为虾夷扇贝(32.05％);马氏珠母贝Kelch-like氨基酸序列的BTB、BACK保守性较高,且Kelch具有保守的GG位点;Kelch-like基因在马氏珠母贝边缘膜组织的相对表达量显著高于其他组织(P<0.05),且贝壳损伤后6、12、120 h时该组织中的基因表达量显著上调(P<0.05);马氏珠母贝Kelch-like基因共有56个SNP位点,其中,31个SNP位点为中度多态,其余位点为低度多态;10个SNP位点形成了1个单倍块,为4种单倍型,其中单倍型AATCTGTCGG为优异单倍型,其壳质量性状显著大于单倍型AGCCTACCGA和单倍型AGCCTACTTA(P<0.05).研究表明,马氏珠母贝Kelch-like可能参与贝壳棱柱层的形成,其单倍型AATCTGTCGG具有作为以壳质量为目标的育种标记的潜力,该结果对于选育具有优良经济性状的马氏珠母贝具有重要意义.
文献关键词：
马氏珠母贝;Kelch-like基因;序列分析;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
杨创业;张丞澍;黄静;郝瑞娟;师尚丽;黄荣莲;周芮;邱金玉;颜翼龙;邓岳文
作者机构：
广东海洋大学 水产学院,广东 湛江524088;广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心,广东 湛江 524088;广东省海水养殖生物育种工程实验室,广东 湛江524088;南方海洋科学与工程广东省实验室 (湛江) ,广东 湛江524006
文献出处：
引用格式：
[1]杨创业;张丞澍;黄静;郝瑞娟;师尚丽;黄荣莲;周芮;邱金玉;颜翼龙;邓岳文-.马氏珠母贝Kelch-like基因的序列及其SNP位点分析)[J].大连海洋大学学报,2022(03):386-393
A类：
AATCTGTCGG,AGCCTACCGA,AGCCTACTTA
B类：
马氏珠母贝,Kelch,like,SNP,Pinctada,fucata,martensii,基因序列,全长,bp,UTR,开放式阅读,可编,氨基酸序列,BTB,结构域,BACK,美洲,牡蛎,虾夷扇贝,保守性,相对表达量,他组织,贝壳,该组,基因表达量,余位,低度,优异单倍型,壳质,质量性状,棱柱,育种,选育,经济性状,序列分析,表达模式
AB值：
0.21842
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