典型文献
基于皮肤转录组的半滑舌鳎无眼侧黑化相关基因的筛选鉴定
文献摘要：
半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)作为比目鱼(Pleuronectiformes)中的代表物种,是我国沿海地区重要的海水经济鱼类.半滑舌鳎体色异常的问题长期以来一直困扰着从业者.导致体色变化的原因多种多样,遗传因素是最根本原因.针对半滑舌鳎无眼侧黑化的研究多在环境、营养、生理、常见色素基因克隆等方面展开,新的功能基因挖掘工作欠缺.本研究选取半滑舌鳎不同体色皮肤进行转录组测序,通过差异基因GO和KEGG富集比对分析,在可能的6条黑色素相关的KEGG通路中筛查差异基因并对差异表达最为显著的10个基因进行了实时荧光定量聚合酶链式反应的验证.本研究找出了半滑舌鳎无眼侧黑化表达显著变化的5个功能基因,分别为txndc、alox15b、ptgs2、ptgisPT-GIS、atp1a2a(p<0.05).其中txndc、alox15b、ptgs2、ptgis基因在黑化组中表达水平高于对照组;功能方面,有3个基因均与花生四烯酸(AA)有一定的相关性,这为多不饱和脂肪酸参与半滑舌鳎体色异常的分子调控机制提供了一定的理论支持.
文献关键词：
皮肤;半滑舌鳎;无眼侧黑化;花生四烯酸;转录组
中图分类号：
作者姓名：
赵娜;何晓旭;贾磊;朱春华;张博
作者机构：
广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025;上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海 201306;天津市水产研究所,天津 300457;天津市农学院,天津 300384
文献出处：
引用格式：
[1]赵娜;何晓旭;贾磊;朱春华;张博-.基于皮肤转录组的半滑舌鳎无眼侧黑化相关基因的筛选鉴定)[J].海洋学报（中文版）,2022(02):57-66
A类：
Pleuronectiformes,txndc,alox15b,ptgs2,ptgisPT,atp1a2a,ptgis
B类：
半滑舌鳎,无眼侧黑化,筛选鉴定,Cynoglossus,semilaevis,比目鱼,沿海地区,水经济,经济鱼类,体色异常,体色变化,多种多样,遗传因素,基因克隆,功能基因,基因挖掘,转录组测序,差异基因,富集比,比对分析,黑色素,差异表达,实时荧光定量聚合酶链式反应,花生四烯酸,AA,多不饱和脂肪酸,分子调控机制
AB值：
0.209069
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