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运用生物信息学方法分析RAS通路中相关基因与宫颈癌转移之间关系的研究
文献摘要：
目的 探究与宫颈癌发展密切相关的信号通路关键分子,运用生物信息学方法来分析RAS蛋白信号通路与宫颈癌转移之间关系.方法 分析受miR-3162-5p调控的信号通路,选出与宫颈癌发展相关的高分通路,运用Oncomine检索通路中的基因在宫颈癌中的表达情况,筛选出差异表达基因,利用STRING和Cytoscape构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)和模块分析.结果 本研究运用生物信息学方法共筛选出了 77个差异表达基因,包括31个高表达基因、42个低表达基因和4个有不同表达趋势的基因.从其中鉴定出24个关键基因,生存分析表明,非受体蛋白酪氨酸磷酸酶11型(PTPN11)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、胰岛素样生长因子1(IGF1)、成纤维细胞生长因子受体2(FGFR2)、G蛋白亚单位γ7-(GNG7)和原癌基因KIT配体(KITLG)可能参与宫颈癌的发生发展、侵袭或复发.免疫组织化学结果提示PTPN11在宫颈癌组织和宫颈非癌上皮中表达差异,差异具有统计学意义(P＜0.05).结论 本研究中发现的差异基因和关键基因有助于了解宫颈癌发生和发展的分子机制,并为宫颈癌的诊断和治疗提供候选靶点.
文献关键词：
宫颈鳞癌;RAS通路;差异基因;生存分析;免疫组织化学法
中图分类号：
作者姓名：
黄巧巧;陈军莹;黄锦冰;徐文生;陈二玲
作者机构：
530021南宁,广西医科大学第一附属医院妇产科
文献出处：
引用格式：
[1]黄巧巧;陈军莹;黄锦冰;徐文生;陈二玲-.运用生物信息学方法分析RAS通路中相关基因与宫颈癌转移之间关系的研究)[J].中华临床医师杂志（电子版）,2022(02):112-123
A类：
GNG7
B类：
生物信息学方法,RAS,关键分,miR,5p,Oncomine,出差,差异表达基因,STRING,Cytoscape,蛋白质相互作用网络,PPI,研究运用,法共,高表达基因,低表达,关键基因,生存分析,受体蛋白,蛋白酪氨酸磷酸酶,PTPN11,血管内皮生长因子,VEGFA,胰岛素样生长因子,IGF1,成纤维细胞生长因子受体,FGFR2,亚单位,原癌基因,KITLG,宫颈癌组织,表达差异,差异基因,诊断和治疗,宫颈鳞癌,免疫组织化学法
AB值：
0.29041
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