利用生物信息学方法,从全基因组水平鉴定枇杷MADS-box基因家族成员,并对其系统进化关系、保守结构域、基因结构、基因复制和启动子顺式作用元件进行分析;同时,结合转录组数据和qRT-PCR结果,分析鉴定出的MADS-box基因家族成员在不同品种和不同成熟阶段的表达情况.本研究共鉴定出89个枇杷MADS-box基因(命名为EjMADS1～EjMADS89),其N端都含有MADS结构域.系统发育树显示,Ⅰ型MADS-box基因有31个,Ⅱ型有58个.Ⅱ型MADS-box基因可划分为14个亚族,同属于一个亚家族的基因有着相似的保守基序.MADS-box基因以不同密度分布在第1～17号染色体上,存在12对串联重复基因.转录组分析表明,在果实成熟过程中,有8个MADS-box基因在果实成熟期间差异表达,其中,Ej-MADS26、EjMADS43和EjMADS41这3个基因序列分别与其他调控果实成熟的SEP亚族基因高度相似,且它们的启动子中都含有赤霉素和脱落酸响应元件.另外,EjMADS37和EjMADS05在不同品种间(特早熟/中晚熟)有明显表达差异.综上,推测EjMADS26、EjMADS43、EjMADS41、EjMADS37和EjMADS05对果实成熟有一定的调控作用.

枇杷;全基因组;MADS-box基因;果实成熟

刘楠;寇燕;李小婷;陈旭;高欢欢;张晶;王超;郑嘉敏;郑国华

福建农林大学园艺学院;福建农林大学园艺产品贮运保鲜研究所,福建 福州350002

福建农林大学学报（自然科学版）

[1]刘楠;寇燕;李小婷;陈旭;高欢欢;张晶;王超;郑嘉敏;郑国华-.枇杷MADS-box全基因组鉴定及其在果实成熟过程中的潜在作用)[J].福建农林大学学报（自然科学版）,2022(03):351-360

EjMADS1,EjMADS89,MADS26,EjMADS43,EjMADS41,EjMADS37,EjMADS05,EjMADS26

枇杷,box,全基因组鉴定,果实成熟,成熟过程,潜在作用,利用生物,生物信息学方法,基因家族,系统进化,进化关系,保守结构域,基因结构,基因复制,启动子,顺式作用元件,转录组数据,qRT,分析鉴定,不同品种,成熟阶段,系统发育树,同属,亚家族,保守基序,不同密度,密度分布,串联重复基因,转录组分析,成熟期,差异表达,基因序列,SEP,赤霉素,脱落酸,响应元,种间,特早熟,中晚熟,表达差异

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