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反刍动物瘤胃噬菌体的宏基因组学研究方法及进展
文献摘要：
病毒(virus)存在于各种动物胃肠道中,反刍动物瘤胃也不例外.瘤胃是一个复杂且多样的微生态系统,包括细菌、真菌、原虫、古生菌和病毒等多种微生物.目前,多组学技术和生物信息学分析手段被广泛用于瘤胃细菌群落的研究.有研究表明,饲粮、环境及宿主基因型会对瘤胃细菌多样性和菌群结构产生影响;瘤胃细菌也会反过来影响宿主机体代谢、生长发育和健康状况.与瘤胃细菌相比,瘤胃病毒受到的关注相对较少.随着分子生物学技术的发展,高通量测序技术为病毒组学的研究提供了必要的支持.研究者们将宏基因组学运用于瘤胃病毒,在瘤胃液中发现了许多新型病毒,极大地丰富了人们对瘤胃病毒多样性的认知.本文从瘤胃噬菌体概念出发,重点阐述了瘤胃病毒DNA提取、测序及生物信息学分析手段,并结合其他环境病毒的研究方法进行探讨,最后对瘤胃病毒宏基因组研究的应用前景进行了总结.
文献关键词：
瘤胃;病毒;噬菌体;宏基因组;高通量测序
中图分类号：
作者姓名：
吴祎程;冉涛;周传社;谭支良
作者机构：
中国科学院亚热带农业生态研究所亚热带农业生态过程重点实验室畜禽养殖污染控制与资源化技术国家工程实验室湖南省动物营养与生理代谢实验室农业部中南动物营养与饲料科学观测站,长沙410125;中国科学院大学,北京100049;兰州大学草地农业科技学院,兰州730020
文献出处：
引用格式：
[1]吴祎程;冉涛;周传社;谭支良-.反刍动物瘤胃噬菌体的宏基因组学研究方法及进展)[J].畜牧兽医学报,2022(01):20-31
A类：
B类：
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AB值：
0.285572
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