典型文献
基于783份大豆种质资源的叶柄夹角全基因组关联分析
文献摘要：
叶柄夹角是影响植株高效受光态势的重要因素,通过调节叶柄夹角实现大豆株型改良,对大豆产量提高非常重要.大豆叶柄夹角为数量性状,目前大多数研究处于QTL定位阶段,已报道的控制叶柄夹角GmILPA1基因也是从突变体中克隆得到,因此亟须发掘更多调控基因及优异等位变异,以促进大豆叶柄夹角调控机制的解析及育种利用.本研究于2019年和2020年分别在海南、北京种植783份和690份大豆种质资源并调查叶柄夹角表型,通过分布于大豆全基因组的单核苷酸多态性(SNP)标记对叶柄夹角进行关联分析.结果表明,不同节位叶柄夹角呈现正态分布,属于典型的数量遗传特征.全基因组关联分析共统计到325个与叶柄夹角显著相关的SNP位点,在顶部节位关联到51个SNP位点,中部节位关联到230个SNP位点,底部节位关联到10个SNPs位点,3个节位的平均值关联到34个SNP位点.显著位点LD block进一步分析得到3个候选基因,第1个是生长素类调节蛋白相关的基因Glyma.05G059700,在茎尖分生组织中特异性表达,第2个是生长素反应因子(AFR)类蛋白相关基因Glyma.06G076900,在叶片和茎尖分生组织中高表达;第3个是COP9信号体复合物相关的基因Glyma.06G076000,在叶片、茎尖分生组织以及茎中均高表达.
文献关键词：
大豆;叶柄夹角;全基因组关联分析
中图分类号：
作者姓名：
陈玲玲;李战;刘亭萱;谷勇哲;宋健;王俊;邱丽娟
作者机构：
长江大学, 湖北荆州 434025;农作物基因资源与遗传改良国家重大科学工程 / 农业农村部种质资源利用重点实验室 / 中国农业科学院作物科学研究所, 北京 100081
文献出处：
引用格式：
[1]陈玲玲;李战;刘亭萱;谷勇哲;宋健;王俊;邱丽娟-.基于783份大豆种质资源的叶柄夹角全基因组关联分析)[J].作物学报,2022(06):1333-1345
A类：
叶柄夹角,GmILPA1,05G059700,06G076900,COP9,06G076000
B类：
大豆种质,种质资源,全基因组关联分析,植株,株高,株型,大豆产量,豆叶,数量性状,QTL,位阶,突变体,须发,调控基因,优异等位变异,角调,调控机制,育种利用,单核苷酸多态性,节位,正态分布,遗传特征,SNPs,LD,block,候选基因,生长素,调节蛋白,白相,Glyma,茎尖分生组织,特异性表达,AFR,复合物
AB值：
0.203752
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