典型文献
发情周期不同阶段绵羊卵巢lncRNA的鉴定和功能分析
文献摘要：
旨在分析不同繁殖周期绵羊卵巢组织中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的表达谱,了解lncRNA表达及其调控机理,为绵羊繁育研究提供理论依据.本研究以湖羊为研究对象,选取年龄在1.5～2.5岁的黄体期和卵泡期母羊各3只,通过高通量测序筛选出卵巢组织中的lncRNA,运用生物信息学分析对差异表达的lncRNA进行靶基因预测,通过GO和KEGG富集分析找出与绵羊繁殖相关的通路.结果显示,本研究共获得1 379个差异表达的lncRNAs,其中1 158个表达上调,221个表达下调.GO和KEGG富集分析表明,差异表达的lncRNAs及其靶基因主要参与卵泡发育、排卵周期过程、钙离子信号通路、卵母细胞减数分裂、催产素信号通路、MAPK信号通路、甲状腺激素合成通路、雌激素信号通路.关键的lncRNAs可能通过调控参与这些信号通路和生物学过程的相关基因来调控生殖.其中,LNC_011239、LNC_012847、LNC_003902、LNC_003906、LNC_003907 等靶向的MAPK1、ADCY1、ADCY5、PPP3CA和CDC23可能发挥关键的调控作用.qRT-PCR验证证明,随机选取的5个差异lncRNAs定量结果与测序结果基本一致.本研究利用RNA-Seq技术筛选出黄体期和卵泡期卵巢组织中的lncRNAs,并进行差异分析,为揭示绵羊繁殖能力的分子机制提供依据.
文献关键词：
卵巢;lncRNA;RNA-seq;绵羊
中图分类号：
作者姓名：
王梦瑶;翟振翰;赵路;王赛桥;王玉琴
作者机构：
河南科技大学动物科技学院,洛阳471023
文献出处：
引用格式：
[1]王梦瑶;翟振翰;赵路;王赛桥;王玉琴-.发情周期不同阶段绵羊卵巢lncRNA的鉴定和功能分析)[J].畜牧兽医学报,2022(12):4221-4231
A类：
ADCY1,CDC23
B类：
发情周期,绵羊,功能分析,繁殖周期,卵巢组织,长链非编码,long,coding,表达谱,调控机理,繁育,湖羊,黄体期,卵泡期,母羊,生物信息学分析,差异表达,靶基因预测,富集分析,共获,lncRNAs,卵泡发育,排卵,钙离子信号通路,卵母细胞,减数分裂,催产素,甲状腺激素,雌激素信号通路,生物学过程,LNC,MAPK1,ADCY5,PPP3CA,qRT,研究利用,Seq,技术筛选,繁殖能力,seq
AB值：
0.334034
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